依營利事業所得稅查核準則第四十五條規定，國內進貨或進料，原始憑證指的是統一發票，企業認為只要有合法的統一發票憑證即可對進貨證明交待過去，然而另外在稅捐稽徵法有核實認定之規定，也就是稅務機關在認定構成課稅要件之事實時，應以實質經濟事實關係及其所生實質經濟利益之歸屬與享有為依據。
所以，企業的商業交易，不再只是取有外來合法憑證即可證明交易了。就進貨或是費用而言，一家有制度的公司確實是有完整的內部憑證的，其流程不外乎是請、採、驗的過程，還有和外部廠商往來的資訊，一直到財務付款流程，這些流程才是真正能證明有商業交易存在之事實。
依國稅局所提出的新聞，
一、 如果無法取得合法憑證，當企業提出交易事實證明時，准按實際進貨價格核定之； 二、 另納稅義務人如主張確有進銷貨事實，除應提出相關資金流程證明外，另應提出交易過程之帳載資料及進銷貨相關憑證，如買賣合約、訂購單、運送簽收及驗收紀錄等相關資料，否則將可能被認定為非實際交易。
以下為內部流程之間單說明，應視不同產業有不同的流程：
請購流程：內部提出之需求，包含產品數量及規格。
採購流程：向廠商的詢價單(估價單)，如有比價，有各家之詢價單，議價決定過程，最後確認之訂單，如有需要應有之合約書，所謂有需要，可能是因為較大金額或是性質特殊，交易內容較為複雜，需以合約內容明定之。
驗收流程：原請購單位確認驗收，包含產品數量及規格，與採購的內容是否有差異等敘明之。
付款流程：由請購單位將請、採、驗流程產生之文件與合法憑證一同提出請款之申請，財務部門依付款條件付款，注意付款對象與交易對象之一致。
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